Ketika voting bailout Century di DPR 3 Maret 2010, Lily menjadi satu-satunya anggota DPR fraksi PKB yang memilih opsi pemberian dana talangan ke Bank Century. Sikap ini berseberangan dengan PKB.
Tahun 2011 Lily kembali berbeda pandangan dengan PKB pada saat voting hak angket pengusutan mafia pajak di DPR. Lily menyatakan setuju untuk mengusut mafia pajak, berseberangan dengan PKB.
Baca juga: Sampaikan Duka Cita atas Wafatnya Lily Wahid, Cak Imin: Ini Duka Indonesia
Akibat dari rangkaian sikap berseberangan tersebut, Lily diberhentikan dari kepengurusan partai, juga keanggotaan DPR.
Pemberhentiannya berbarengan dengan pemecatan sahabatnya, Effendi Choirie atau Gus Choi yang juga kerap memiliki sikap bertentangan dengan partai.
Keduanya diberhentikan sebagai anggota DPR melalui Keputusan Presiden Nomor 21/P Tahun 2013 yang ditandatangani Presiden Susilo Bambang Yudhoyono (SBY) pada 14 Maret 2013
Atas rekam jejaknya itulah, Lily dikenal sebagai politisi perempuan yang berani membela kepentingan rakyat.
Simak breaking news dan berita pilihan kami langsung di ponselmu. Pilih saluran andalanmu akses berita Kompas.com WhatsApp Channel : https://www.whatsapp.com/channel/0029VaFPbedBPzjZrk13HO3D. Pastikan kamu sudah install aplikasi WhatsApp ya.